Merkingarvélar fyrir flatt-yfirborð setja merkimiða og filmur á efstu flata eða bogadregna yfirborð vinnuhluta, eins og kassa, bækur og plastskeljar. Þeir bjóða upp á bæði rúllu- og sogaðferðir, þar sem val byggist fyrst og fremst á skilvirkni, nákvæmni og kröfum um loftbólustýringu. Hringlaga flöskumerkingarvélar setja merkimiða eða filmur á ummál sívalur eða keilulaga vara, svo sem gler- og plastflöskur. Þeir geta framkvæmt ummáls-, hálf-hringlaga, tvíhliða-hliða ummáls- og ummálsstaðsetningarmerkingaraðgerðir og eru aðallega fáanlegar með lóðréttum og láréttum merkingaraðferðum.

Hliðar-hliðarmerkingarvélar setja merkimiða eða filmur á hlið flata eða bogadregna yfirborð vinnuhluta, eins og flatar snyrtivöruflöskur og ferkantaða kassa. Þeir geta verið notaðir með hringlaga flöskumerkingarbúnaði fyrir samtímis hringlaga flöskumerkingar.

Einnig er hægt að flokka sjálfvirkar merkingarvélar eftir merkingarhlutnum, svo sem brettamerkingar og óreglulegar-merkingarvélar. Samkvæmt merkingaraðferðinni eru aðallega sogmerkingar, rúllumerkingar, burstamerkingar, loftblástursmerkingar og þurrk-á merkingum. Í samræmi við hversu sjálfvirknin er, má skipta þeim í handvirkar merkingarvélar, hálf-sjálfvirkar merkingarvélar og fullsjálfvirkar merkingarvélar. Samkvæmt virkni eru til einhliða-merkingarvélar, tvíhliða-merkingarvélar, fjöl-merkingarvélar og samþættar prent- og merkingarvélar.